Es quizás el reservorio subterráneo transfronterizo de agua dulce más grande del planeta. Se extiende desde la cuenca sedimentaria del Paraná a la cuenca Chaco-Paranaense. Subyace cuatro países: Argentina, Brasil, Paraguay y Uruguay. Tiene una extensión aproximada de 1,2 millones de km², de los cuales 840.000 km² se encuentran en Brasil, 225.500 km² en el territorio Argentino, 71.700 km² en Paraguay y 58.000 km² en Uruguay. Se estima que las reservas permanentes del acuífero son del orden de los 25.000 km³.
Uno de los problemas existentes es el riesgo de deterioro del acuífero debido al aumento de los volúmenes explotados y al aumento de las diferentes fuentes de contaminación. Esa situación exige un gestionamiento adecuado de las condiciones de aprovechamiento del acuífero por parte de todas las esferas gubernamentales.
El Proyecto Acuífero Guaraní va a contribuir a mejorar la situación actual a través de la formulación de un modelo técnico, legal e institucional destinado a la gestión de los recursos del acuífero de forma coordinada por el conjunto de los países e instituciones involucradas.
Los estudios se concentrarán especialmente en áreas críticas (“hot spots”). Aquí se desarrollarán medidas de gestión del agua subterránea y de mitigación de daños de acuerdo a las características de cada área.